Trung tâm đổi mới sáng tạo quốc gia có tổng mức đầu tư khoảng 740 tỷ đồng từ nguồn vốn huy động ngoài ngân sách, do các doanh nghiệp đóng góp xây dựng, bước đầu từ một số nhà tài trợ.
